исключить лишнее слово "она замолчала, ожидая от меня ответной реакции, вот только я совсем запутался и не знал, что сказать"

В данном предложении лишним словом является "замолчала", так как оно дублирует смысл, который уже передается словом "ожидая". Предложение можно переформулировать, убрав лишний глагол: "она, ожидая от меня ответной реакции, вот только я совсем запутался и не знал, что сказать".