Кладограммы можно создавать путём сравнения как нуклеотидных последовательностей ДНК, так и аминокислотных в белках, причём не всегда результаты анализа совпадают (см., например, рисунок). Почему основанные на последовательностях ДНК кладограммы оказываются более надёжными для реконструкции филогенетического родства видов? Несколько разных триплетов нуклеотидов могут кодировать одну и ту же аминокислоту. ДНК мутирует, а белки – нет. Аминокислоты менее химически стабильны, чем нуклеотиды ДНК. Различных вариантов белков гораздо больше, чем вариантов генов. При замене любой аминокислоты в последовательности белка он теряет свою функцию, а при замене нуклеотида – нет.
Основанные на последовательностях ДНК кладограммы оказываются более надёжными для реконструкции филогенетического родства видов из-за нескольких причин:
Несколько разных триплетов нуклеотидов могут кодировать одну и ту же аминокислоту. Из-за этого, при сравнении аминокислотных последовательностей белков, мы можем упустить различия, которые могут быть важными для филогенетической реконструкции.
ДНК мутирует, а белки - нет. Белки могут испытывать другие факторы, такие как естественный отбор и функциональные ограничения, что может влиять на их последовательность. Это может затруднить правильную установку филогенетических связей на основе аминокислотных последовательностей.
Аминокислоты менее химически стабильны, чем нуклеотиды ДНК. Это означает, что они могут более вероятно подвергаться мутациям или химическим изменениям, которые могут исказить информацию о филогенетическом родстве.
Различных вариантов белков гораздо больше, чем вариантов генов, поскольку один ген может кодировать несколько специфических вариантов белков. Это может привести к сложностям в правильном выравнивании и интерпретации последовательностей белков для филогенетического анализа.
При замене любой аминокислоты в последовательности белка, он теряет свою функцию, в то время как при замене нуклеотида в ДНК это может не привести к таким же серьезным последствиям. Это может оказывать влияние на эволюционные изменения и филогенетические отношения между видами.
Надеюсь, это помогло вам понять, почему основанные на последовательностях ДНК кладограммы являются более надежными для реконструкции филогенетического родства видов. Если у вас возникнут еще вопросы, не стесняйтесь задавать их.
