В анафазе I мейоза происходит разделение хромосомные пар, образованные в результате первого деления мейоза. При этом каждая хромосома перемещается к противоположным полюсам клетки. Таким образом, в каждой дочерней клетке окажется случайным образом смешанная хромосомная пара, состоящая из гомологичных хромосом.
В анафазе II мейоза происходит разделение сестринских хромосом. Каждая хроматида, образовавшаяся в результате дублирования хромосом в интерфазе, перемещается к противоположным полюсам клетки. После завершения анафазы II возникают 4 гаплоидные дочерние клетки.
Сравнивая анафазу I и анафазу II мейоза с интерфазой, можно отметить, что в интерфазе хромосомы дублируются, образуя сестринские хроматиды (материнская и дочерняя). Во время анафазы I хромосомы отделяются по гомологии, а в анафазе II - по систерности. Таким образом, основное отличие заключается в процессе подвижности хромосом и их разделении в разные фазы мейоза по отношению к интерфазе.