Можно ли написать: Я с 3н. школа брала только Литературу, Математику, Географию, Информатику, Всеобщая история, Историю Азербайджана, Химию, Физику и географию, а остальное всё с К.Худатской школы.

Да, конечно, можно написать: "Я в 3-й школе изучала только Литературу, Математику, Географию, Информатику, Всеобщую историю, Историю Азербайджана, Химию, Физику и географию, а остальные предметы изучала в К.Худатской школе." Важно указывать ясно и четко, какие предметы изучались в каких школах для ясного понимания вашего учебного пути. Все в порядке, удачи в изучении дополнительных предметов!