В данном предложении запятая должна быть поставлена для разделения частей сложносочиненного предложения, а также перед вводным словом. Правильный вариант звучит так:
«Поезд по узкоколейной дороге мчится с какой-то особой железной бодростью, мелькая мимо деревень и возделанных полей.»
Запятая стоит перед словом «мелькая», так как это обособляет вторую часть предложения, описывающую действие. Это делает текст более ясным и читабельным. Если у вас есть дополнительные вопросы по пунктуации или другим темам, пожалуйста, задавайте!