В вашем вопросе указаны различные варианты судебных способов защиты прав. Чтобы выбрать наиболее подходящий, следует учитывать, какой конкретно право или интерес защищается.
Оспаривание решения Палаты по патентным спорам в порядке арбитражного судопроизводства - применяется, если судится вопрос, связанный с патентным правом.
Обжалование решения Роспатента в Палату по патентным спорам - это административный способ защиты, если вы хотите обжаловать административное действие Роспатента.
Обжалование действия субъекта контроля в рамках государственных и муниципальных контрактов в контрольный орган - также административный способ, если есть споры с государственными органами по контрактам.
Обжалование постановления о привлечении к административной ответственности, вынесенное судьей - это способ защиты прав в области административного судопроизводства.
Таким образом, каждый способ защиты применим в своей сфере. Если вы ориентируетесь на сферу арбитражного и патентного права, то правильным будет оспаривание решения Палаты по патентным спорам в порядке арбитражного судопроизводства.