Во время Великой Отечественной войны (1941-1945 годы) существовал Государственный комитет обороны, Верховный совет СССР и Совет народных комиссаров. Однако Министерство иностранных дел продолжало существовать, хотя и в условиях войны его функции могли изменяться.
Наиболее корректный ответ на ваш вопрос — это Совет народных комиссаров, который был преобразован в Совет Министров в 1946 году. Однако до конца войны, в формальном смысле, этот орган все еще существовал. Так, никаких органов, которые бы вообще не существовали во время войны, на самом деле не было. Но если рассматривать именно время после войны, то «Совет народных комиссаров» утратил свою актуальность как орган власти именно в 1946 году.
Если вы хотите узнать о тех, кто не существовал с самого начала войны, то правильного ответа не будет, поскольку все указанные органы власти функционировали хотя бы в какой-то форме.