Задача 4. У фрагменті одного ланцюга молекули ДНК нуклеотиди розміщені в такій послідовності: ААГ-ТГЦ-ГГТ-АГЦ-АТТ-ЦГА. Побудуйте схему дволанцюгової ДНК. Визначте довжину і масу…

Щоб побудувати дволанцюгову ДНК з даної послідовності нуклеотидів, необхідно пам'ятати про комплементарність баз. Нуклеотиди в ДНК паруються наступним чином:

• А (аденін) - Т (тимін)
• Т (тимін) - А (аденін)
• Г (гуанін) - Ц (цитозин)
• Ц (цитозин) - Г (гуанін)

Задані нуклеотиди: ААГ-ТГЦ-ГГТ-АГЦ-АТТ-ЦГА.

1. Сформулюємо комплементарну послідовність для даної ланцюга:
   • ААГ -> ТТЦ
   • ТГЦ -> АЦГ
   • ГГТ -> ЦЦА
   • АГЦ -> ТCG
   • АТТ -> ТAA
   • ЦГА -> GCT

Отже, комплементарний ланцюг буде: ТТЦ-АЦГ-ЦЦА-ТCG-ТAA-GCT.

2. Тепер запишемо дволанцюгову структуру ДНК:

  5' - ААГ - ТГЦ - ГГТ - АГЦ - АТТ - ЦГА - 3'
  3' - ТТЦ - АЦГ - ЦЦА - ТCG - ТAA - GCT - 5'

3. Визначимо довжину фрагмента:

• Кожен нуклеотид складається з одного з чотирьох основ, фосфатної групи та цукру. У вашому фрагменті 6 нуклеотидів, отже, довжина фрагмента ДНК у парах основ (п.б.) буде 6.

4. Тепер визначимо масу фрагмента. Приблизні середні молекулярні маси нуклеотидів:

• Аденін (A): приблизно 331 г/моль
• Тимін (T): приблизно 322 г/моль
• Цитозин (C): приблизно 307 г/моль
• Гуанін (G): приблизно 347 г/моль

У даній послідовності у вас:

• A (2 рази) = 2 * 331 = 662 г/моль
• T (4 рази) = 4 * 322 = 1288 г/моль
• C (4 рази) = 4 * 307 = 1228 г/моль
• G (4 рази) = 4 * 347 = 1388 г/моль

Сумарна маса фрагмента: 662 + 1288 + 1228 + 1388 = 3566 г/моль

Отже, довжина даного фрагмента ДНК - 6 пар основ, а його маса приблизно 3566 г/моль.