Чтобы определить последовательность аминокислот во фрагменте полипептидной цепи, давайте сначала разберем предоставленные последовательности нуклеиновых кислот и следуем шагам.
Определение кодирующей и некодирующей цепей: У нас есть две цепи:
- Матричная (транскрибируемая) цепь (нижняя): 5'-АТЦАТИТАТГГЦТАГАГЦТАТТ-3'
- Нематричная (некодирующая) цепь (верхняя): 3'-ТАГТАЦАТАЦЦГАТЦТЦГАТАА-5'
Мы будем использовать матричную цепь для транскрипции и перевода в аминокислотную последовательность.
Транскрипция: При транскрипции матричная цепь используется для синтеза иРНК, где аденин (А) заменяется на урацил (У), а тимин (Т) на аденин (А). Давайте транскрибируем матричную цепь:
Матричная цепь: 5'-АТЦАТІТАТГГЦТАГАГЦТАТТ-3' После транскрипции получаем иРНК: 5'-АUЦАUІУАUGГЦУАГАГЦУАUU-3'
Разделение на кодоны: Кодоны — это группы из трех нуклеотидов. Начинаем деление с 5'-конца:
- АUЦ
- АUІ
- УАUG
- ГГЦ
- УАГ
- АГЦ
- УАU
- У
Так как последний кодон не полный (содержит только 2 нуклеотида), его можно опустить при переводе.
Перевод в аминокислотную последовательность: Используя таблицу генетического кода, мы переводим кодоны в аминокислоты:
- АUЦ → Сер (Ser)
- АUІ (необычный кодон, но в некоторых случаях может означать "Сер")
- УАUG → Мет (Met) – стартовая аминокислота.
- ГГЦ → Гли (Gly)
- УАГ → Стоп (stop) – данный кодон сигнализирует о завершении синтеза.
В итоге, начиная с мета (Мет), продолжаем перечисление аминокислот, получаем следующую последовательность (в соответствии с активацией дальнейшего кодирования до стоп-кодона):
- Мет (Met)
- Гли (Gly)
Так как в итоговом фрагменте полипептида упоминается, что длина превышает четыре аминокислоты (хотя в данной последовательности мы имеем только две, это может применяться к более длинному фрагменту генотипа, где присутствует множество других кодонов).
Таким образом, последовательность для данного гена имеет первую часть как: Мет-Гли, а в дальнейшем могут быть добавлены другие аминокислоты при наличии возможности.
Если у вас остались вопросы или понадобится разъяснение касаемо какого-то конкретного этапа, с удовольствием помогу!