Вам дана последовательность нуклеотидов ДНК, которая будет выступать матрицей Для ПЦР: 5-ATGGGCATCGATGCATOGACTAGACGTAGCACOGAT-3 Выберите верную последовательность обратного…
Вам дана последовательность нуклеотидов ДНК, которая будет выступать матрицей Для ПЦР: 5-ATGGGCATCGATGCATOGACTAGACGTAGCACOGAT-3 Выберите верную последовательность обратного праймера длиной в 8 л.н. (даны последовательности в направлении от 5-к 3-концу).
Для выбора обратного праймера длиной 8 нуклеотидов, необходимо определить комплементарную последовательность к заданной матрице, начиная с 3 конца этой последовательности. Ваша последовательность матрицы ДНК:
5'-ATGGGCATCGATGCATOGACTAGACGTAGCACOGAT-3'
Для определения обратного праймера, мы будем читать последовательность с конца. Сначала укажем нуклеотиды в обратном порядке и затем заменим их на комплементарные. Важно учесть, что в данной последовательности присутствуют нуклеотиды "O", которые не являются стандартными (в ДНК стандартными являются A, T, C и G).
Если мы начнем с конечных 8 нуклеотидов (с 3' конца), то они будут выглядеть так:
3'-TAGCACOG-5'
Теперь заменим их на комплементарные нуклеотиды:
- T (аденин A)
- A (тимин T)
- G (цитозин C)
- C (гуанин G)
- A (тимин T)
- C (гуанин G)
- O (недопустимый нуклеотид, его можно игнорировать или заменить)
- G (цитозин C)
Комплементарная последовательность без "O":
5'-CGTGTAC-3'
Таким образом, правильный обратный праймер длиной 8 нуклеотидов — это:
5'-CGTGTAC-3'
Если допустимо игнорировать "O", то данный праймер будет хорошим выбором для ПЦР. Пожалуйста, уточните, если есть дурные варианты или дополнительные условия, и я помогу вам с ними!
