Чтобы определить, в каких предложениях неправильно выделена грамматическая основа, следует обратить внимание на правильное выделение подлежащего и сказуемого.
Нашего учителя мы считали другом. - Здесь грамматическая основа выделена правильно: подлежащее "мы", сказуемое "считали".
Пользоваться электроинструментом нужно очень осторожно. - В этом предложении также всё правильно: подлежащее "пользоваться электроинструментом", сказуемое "нужно".
Десять ночей подряд она не находила себе места, переживая за сына. - Здесь выделение неверное. Подлежащее "она", сказуемое "не находила". "Переживая за сына" является обстоятельством и не входит в грамматическую основу.
Мы с ним опоздали на встречу с товарищем. - В этом предложении всё корректно: подлежащее "мы с ним", сказуемое "опоздали".
Мне необходимо сойти на этой остановке. - Грамматическая основа выделена правильно: подлежащее "мне", сказуемое "необходимо сойти".
Таким образом, неправильно выделена грамматическая основа в предложении 3.