Что должно стоять на месте 2 пропуска? При недостижении согласия между сторонами по отдельным положениям проекта (1) в течение (2) со дня начала коллективных переговоров стороны составлением должны подписать (1) на согласованных условиях с одновременным (3).

На место первого пропуска (1) может подойти слово "соглашение", а на место второго пропуска (2) можно вставить выражение "определённого срока" или "установленного срока". Например:

"При недостижении согласия между сторонами по отдельным положениям проекта (соглашение) в течение (определённого срока) со дня начала коллективных переговоров стороны составлением должны подписать (соглашение) на согласованных условиях с одновременным (3)".

Важно подбирать слова, которые лучше всего соответствуют контексту предложения.