Что должно стоять на месте 3 пропуска? При недостижении согласия между сторонами по отдельным положениям проекта (1) в течение (2) со дня начала коллективных переговоров стороны составлением должны подписать (1) на согласованных условиях с одновременным (3).

На место (3) в данном контексте обычно ставят «достижением соглашения» или «подписанием документа». То есть полный текст может выглядеть следующим образом:

"При недостижении согласия между сторонами по отдельным положениям проекта (1) в течение (2) со дня начала коллективных переговоров стороны должны составить (1) на согласованных условиях с одновременным (3) подписанием документа."

Если необходимо конкретное слово, то возможен вариант: "протокола".