Сергеев вышел на берег (1) но (2) когда у пристани на огромной груде апельсинов увидел незнакомого китайца (3) то вдруг пронзительно и ясно ощутил (4) как далеко от него Родина.…

В данном предложении следует расставить запятые следующим образом:

Сергеев вышел на берег (1), но (2) когда у пристани на огромной груде апельсинов увидел незнакомого китайца (3), то вдруг пронзительно и ясно ощутил (4), как далеко от него Родина.

Запятые ставятся перед "но" в соответствии с правилами, а также перед "когда" и "как" в зависимости от контекста.