Неравновесие по сцеплению (linkage disequilibrium, LD) - неслучайная ассоциация аллелей в двух или более локусах. Для двух аллелей LD рассчитывается по формуле LD AB = РАВ — РА*РВ…
Неравновесие по сцеплению (linkage disequilibrium, LD) - неслучайная ассоциация аллелей в двух или более локусах. Для двух аллелей LD рассчитывается по формуле LD AB = РАВ — РА*РВ = РАВ*Раь — РАь*РаВ, которая равна разнице между частотой гамет, несущих пару аллелей А и В в двух локусах (РАв), и произведением частот этих аллелей ( Ра и рв). Считая, что LD дв = 0 означает, что аллели А и В наследуются независимо друг от друга, укажите, какие эволюционные события могут приводить к появлению ненулевого LD. Прохождение популяцией, используемой для расчета L.D, бутылочного горлышка. Определенная комбинация аллелей в локусах А и В характеризуется повышенной приспособленностью, чем эти аллели по отдельности. Отсутствие в популяции, используемой для расчета L.D. возможности к самооплодотворению. Гермафродитазм особей, которые формируют популяцию, используемую для расчета ID. Свободное скрещивание особей в популяции, используемой для расчета LD.
Неравновесие по сцеплению (linkage disequilibrium, LD) может возникать в результате различных эволюционных процессов. Вот несколько факторов, которые могут приводить к появлению ненулевого LD:
Бутылочное горлышко: Когда популяция проходит через фазу сокращения численности (бутылочное горлышко), это может привести к уменьшению генетического разнообразия и неслучайной ассоциации аллелей. Несколько аллелей могут оказаться связаны друг с другом по мере восстановления популяции, что приводит к появлению LD.
Селективное давление: Если определенная комбинация аллелей в локусах A и B обеспечивает особям повышенную приспособленность по сравнению с другими комбинациями, это может приводить к неслучайной ассоциации аллелей и возникновению LD. Отбор будет способствовать сохранению таких комбинаций.
Самооплодотворение: Если в популяции есть высокая степень самооплодотворения, это может вести к ограничению гамет, что, в свою очередь, может привести к возникновению LD. Однако в случае чрезмерного самооплодотворения также может возникнуть LD на основе рекомбинации.
Гермафродитизм: В популяциях с гермафродитными особями может иметь место более высокая вероятность сохранения определенных аллелей вместе, что также может способствовать образованию LD.
Условия свободного скрещивания: В условиях свободного скрещивания между особями в популяции вероятность появления LD уменьшается, поскольку аллели будут более равномерно перемешиваться. Однако, если имеются какие-либо ограничения (например, географические или эколого-генетические), это может привести к образованию LD.
Таким образом, наличие ненулевого LD может быть следствием различных эволюционных процессов и условий, которые влияют на динамику аллельной частоты в популяции.
