В приведенных предложениях нужно расставить знаки препинания для лучшего понимания их структуры. Рассмотрим каждое из них:
Мыши кроты землеройки в корнях деревьев
В этом предложении необходимо выделить однородные члены предложения с помощью запятой:
Мыши, кроты, землеройки в корнях деревьев.Свернула молния и разразилась гроза
Это простое предложение с союзом "и". Запятая здесь не требуется, так как нет обособляемых частей. Оно может быть записано без изменений.Дождь звучит стучал по деревянной крыше
Здесь нужно добавить запятую перед "стучал", чтобы отделить два сказуемых:
Дождь звучит, стучал по деревянной крыше.
Таким образом, предложение, в котором требуется одна запятая, - это третье: Дождь звучит, стучал по деревянной крыше.