Подчеркните подлежащее указав чем оно выраженно: Они дышали вечность, эти звуки, всею свежестью, всем равнодушием, всею силою вечности. Голос самой природы слышался мне в них.

В приведённом вами предложении подлежащее выражено местоимением "они".

Вот детальный разбор:

1. Подлежащее – это главный член предложения, который отвечает на вопросы "кто?" или "что?" и обозначает, о ком или о чём идёт речь.
2. В вашем примере подлежащее "они" указывает на людей или существа, которые выполняют действие дышания.

Таким образом, подлежащее в данном контексте выделяется как "они". Вы можете подчеркнуть его в предложении для лучшего визуального понимания.