Давайте разберем каждое пунктуационное правило и подберем к нему соответствующее предложение.
А) Вводные конструкции обособляются.
Это правило подходит к предложению 4: "Впрочем, и в мировом списке университет оказывается в первой сотне по некоторым предметным дисциплинам." Здесь "Впрочем" является вводной конструкцией и обособляется запятыми.
Б) Между подлежащим и сказуемым, выраженными именами существительными в именительном падеже, при нулевой связке ставится тире.
Это правило подходит к предложению 1: "Московский физико-технический институт (МФТИ) - ведущий российский вуз по подготовке специалистов в области естественных и точных наук..." Здесь мы видим тире между подлежащим и сказуемым, которые оба выражены существительными.
В) Между частями сложного бессоюзного предложения ставится двоеточие, если вторая часть поясняет, дополняет первую.
Это правило подходит к предложению 3: "Уровень подготовки в МФТИ высоко оценивается в России: практически все рейтинги включают вуз в тройку лучших." Вторая часть поясняет первую.
Соответственно, последовательность цифр, которая соответствует буквам в порядке АБВ, будет: 413.