реши эту задачу Фрагмент начала гена имеет следующую последовательность нуклеотидов (верхняя цепь матричная (транскрибируемая)): 5'-ТГГЦАТГЦТААТАЦГЦЦАТЦЦАГ-3'…
Реши эту задачу Фрагмент начала гена имеет следующую последовательность нуклеотидов (верхняя цепь матричная (транскрибируемая)): 5'-ТГГЦАТГЦТААТАЦГЦЦАТЦЦАГ-3' 3'-АЦЦГТАЦГАТТАТГЦГГТАГГТЦ-5' Определите верную открытую рамку считывания и найдите последовательность аминокислот во фрагменте начала полипептидной цепи. При ответе учитывайте, что полипептидная цепь начинается с аминокислоты тир. Известно, что итоговый полипептид, кодируемый этим геном, имеет длину более пяти аминокислот.
Для решения задачи определим открытую рамку считывания (ОРС) и найдем последовательность аминокислот. ОРС – это часть мРНК, которая как раз транскрибируется от ДНК и считывается рибосомами для синтеза белка. Так как полипептидная цепь начинается с аминокислоты тирозин (Тир), кодируемой триплетом АУГ, важно правильно установить рамку считывания.
Транскрипция нуклеотидов: Начнем с определения и комплементарной последовательности мРНК, исходя из матричной нуклеотидной цепи. Матрица (нижняя цепь) 3'-АЦЦГТАЦГАТТАТГЦГГТАГГТЦ-5' будет транскрибироваться в мРНК:
5'-ТГГЦАТГЦТААТАЦГЦЦАТЦЦАГ-3' (матрица) | 5'-УГГЦАУГЦУАУАЦГЦЦАУЦЦАГ-3' (мРНК)
Поиск кодонов: Теперь считаем кодоны, начиная с 5'-конца в мРНК. Кодоны будут разбиты на триплеты:
- УГГ (Триптофан)
- ЦАУ (Истинное значение: этот кодон не является стартовым, переходим к следующему триплету)
- ГЦУ (Аланин)
- АУЦ (Изолейцин)
- ГЦЦ (Аланин)
- АУЦ (Изолейцин)
- ЦАГ (Глутамин)
Определение первой рамки: Мы можем пересчитывать рамки, чтобы найти первую такую, которая начинается с кодона АУГ (тирозин). Из этого следует:
Проверим позиции триплетов:
- Если начинаем с 1 позиции: УГГ, ЦАУ (не подходит)
- Если начинаем со 2 позиции: ГЦА, УАЦ (не подходит)
- Если начинаем с 3 позиции: ЦАУ, ГЦЦ (не подходит, так как нет стартового кодона)
Из анализа видно, что в данной цепи малая вероятность наличия стартового кодона. Обычно, более длинные ДНК строки содержат несколько рамок считывания и потенциальных стартовых триплетов.
- Составим аминокислоты и итог: Если предположить, что действительно никаких стартовых показывает нет, основание уже может указывать на другой участок. Если бы мы нашли триплет АУГ, серия бы выглядела бы так:
- Начнем с Тирозина (АУГ), и далее очерёдность аминокислот бы продолжилась из найденных триплетов.
Поскольку в предоставленной последовательности начальный кодон (АУГ) отсутствует, значит, исходная информация должна быть пересмотрена, чтобы соответсвовать правильным рамкам считывания. Если у вас есть более конкретные данные или требуется другой фрагмент, это позволит анализу в верной перспективе.
