В сложноподчинённых предложениях придаточная часть может находиться внутри главной в тех случаях, когда она дополняет какую-либо часть главного предложения, например, определяет существительное или уточняет сказуемое.
В вашем примере предложение "Местность, где находился дом Лепутана, была за Москвой-рекою к Яузе, где-то на бережку" демонстрирует этот принцип. Здесь "где находился дом Лепутана" является придаточным определительными и уточняет информацию о местности.
Другие примеры, где придаточная часть находится внутри главной:
- "Я помню тот день, когда мы встретились." – здесь придаточная часть "когда мы встретились" уточняет, о каком дне идет речь.
- "Это тот фильм, который я тебе рекомендовал." – придаточная часть "который я тебе рекомендовал" уточняет, какой именно фильм имеется в виду.
Таким образом, придаточные могут находиться внутри главного предложения, выступая в роли определения, поясняющего обстоятельства действия или уточняющего значение.