Чтобы определить, с какого нуклеотида начинается информативная часть гена, нужно найти стартовый кодон, который вводит в процесс трансляции. В большинстве случаев, стартовым кодоном является триплет AUG, который кодирует аминокислоту метионин (Мет).
В приведённой вами последовательности, смотрим на транскрибируемую цепь нуклеотидов (нижняя цепь):
3’ − АТТАЦТГГЦГТАТАТАГГТА −5’.
Для нахождения информативной части гена, трансрибируемая последовательность должна быть переведена в соответствующие триплеты. При этом кодирование начинается с 5' конца (со стороны, где начинается транскрипция).
Теперь, используя транскрибируемую цепь, давайте проанализируем последовательность:
Разобьём последовательность на триплеты:
- 5’ − АТТ | АЦТ | ГГЦ | ГТАТ | АТА | ГГТ | А − 3’
Теперь проверяем триплеты на наличие кодонов. Нам нужно найти «АUG». Однако, в этой последовательности «А» (аденин) находится в самом начале и может быть частью другого кодона, поэтому мы ищем следующий подходящий вариант.
Находится ли «АУГ» здесь? Нет, поскольку указанные триплеты не содержат графически такого сочетания. Важно отметить, что триплет «АУГ» может быть представлен как:
- В случае кодирования «Мет» может возникнуть:
- Верно: «АЦТ» или другие кодоны. В данной последовательности, будет так:
- «АУГ» начинается с «А» как особый стартовый кодон.
Следовательно, информативная часть гена начнется с нуклеотида «А», который соответствует первой букве в этом триплете «АUG».
Таким образом, информативная часть гена начинается с нуклеотида «А».