Известно что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельна 15 концу одной цели соответствует 3 конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается в 5 конца.…
Известно что комплементарные цепи нуклеиновых кислот антипараллельна 15 концу одной цели соответствует 3 конец другой цепи). Синтез нуклеиновых кислот начинается в 5 конца. Рибосома движется по иРНК в направлении от 5 и 3 концу. Ген инект кодирующую и некодирующую области. Кодирующая області. Гена называется открытой рамной считывания Фрагмент конца гена имеет следующую последовательность нуклеотидов (верхняя цель матричная (транскрибируемая)) 5-ТГЦГЦТААЦТГЦГАТГТГАГЦТАТАЦЦ-3 3-АЦГЦГАТТГАЦГЦТАЦАЦТЦГАТАТΓΓ-5 Определите верную открытую рамку стчегвайания и найдите последовательность аминокислот во фрагменте конца полипептидной цепид Известно, что итоговый полипептид, кодирусный этим геном, иноетально Более пяти аминокислот.
Чтобы определить открытую рамку считывания (ОРС) и установить последовательность аминокислот, сначала нужно обратить внимание на предложенные цепи нуклеиновых кислот и определить их кодирующую область.
Исходя из предоставленной информации, у вас есть следующая цепочка матричной ДНК (или иРНК):
5-ТГЦГЦТААЦТГЦГАТГТГАГЦТАТАЦЦ-3
Следует найти начальный кодон (обычно это AUG в случае иРНК), чтобы установить правильную рамку считывания. Для дальнейшего анализа, давайте сначала выполните транскрипцию этой последовательности в иРНК. Поскольку в вашем вопросе указана матричная ДНК, вам необходимо собрать соответствующую последовательность иРНК:
Транскрипция:
- 5-ТГЦГЦТААЦТГЦГАТГТГАГЦТАТАЦЦ-3 (матрица ДНК)
- 5-УГЦГЦУААЦУГЦГАУГУГАГЦУАУАЦЦ-3 (иРНК)
Определение рамок считывания: Теперь нужно найти все возможные рамки считывания (по 3 нуклеотида):
- 1-я ОРС: УГЦ-ГЦУ-ААЦ-УГЦ-ГАУ-ГУГ-АГЦ-УАУ-АЦЦ
- 2-я ОРС: ГЦУ-ААЦ-УГЦ-ГАУ-ГУГ-АГЦ-УАУ-АЦЦ (сдвиг на 1)
- 3-я ОРС: ААЦ-УГЦ-ГАУ-ГУГ-АГЦ-УАУ-АЦЦ (сдвиг на 2)
Теперь из всех рамок нужно найти открывающий кодон (AUG). На первом шаге мы смотрим, присутствует ли AUG. Так как в данной последовательности его нет, можно предположить, что это не начальная рамка.
- Перевод в аминокислоты: Давайте следующий кодон, который мы можем использовать, чтобы начать определять последовательность аминокислот. Мы будем использовать стандартную генетическую таблицу.
Примечание: так как в вашей предоставленной цепи не указано местоположение AUG и нет явных начальных кодонов, мы будем использовать доступные мРНК кодоны, начиная с 5 конца:
Предположим, что начинается с первого доступного, например: ГЦУ (диптер) и продолжим.
- ГЦУ — Алани(А)
- ААЦ — Аспарагин (N)
- УГЦ — Серин (S)
- ГАУ — Аспартат (D)
- ГУГ — Валин (V)
- АГЦ — Серин (S)
- УАУ — Тирозин (Y)
- АЦЦ — Треонин (T)
Таким образом, последовательность аминокислот может быть: А — N — S — D — V — S — Y — T.
С помощью этого подхода вы можете продолжать просматривать рамки считывания для определения более полного полипептидного последовательности. Тщательно проверяйте наличие начального и конечного кодонов в любой из рамок, чтобы правильно проанализировать ген.
