Вот исправленные предложения с подчеркиванием грамматических основ и графическим обозначением частей:
Там, где есть растительный перегной, вода в реках прозрачная, а в глинистой почве она замутнена.
- Грамматическая основа: "вода" (подлежащее) + "замутнена" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "где есть растительный перегной" (придаточная часть).
- Средства связи: "где", "а".
Там, где говорит научная любознательность, соображениям личного порядка места не остается.
- Грамматическая основа: "места" (подлежащее) + "не остается" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "где говорит научная любознательность" (придаточная часть).
- Средства связи: "где".
Там, где растут высокие тополя, и есть потайная дверь.
- Грамматическая основа: "потайная дверь" (подлежащее) + "есть" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "где растут высокие тополя" (придаточная часть).
- Средства связи: "где".
Мы посмотрели туда, где зелёные заросли окаймляли края скал, но не увидели ни малейшего движения.
- Грамматическая основа: "мы" (подлежащее) + "посмотрели" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "где зелёные заросли окаймляли края скал" (придаточная часть).
- Средства связи: "где", "но".
Но там, где интеллект и воля действуют заодно, выход всегда найдётся.
- Грамматическая основа: "выход" (подлежащее) + "найдётся" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "где интеллект и воля действуют заодно" (придаточная часть).
- Средства связи: "где".
Когда Челленджер карабкался вверх по камням, она одним ударом своего свирепого изогнутого клюва, как долотом, сорвала ему каблук.
- Грамматическая основа: "она" (подлежащее) + "сорвала" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "Когда Челленджер карабкался вверх по камням" (придаточная часть).
- Средства связи: "Когда".
Когда мы спускались вниз по реке, нашу лодку перевернуло.
- Грамматическая основа: "лодку" (подлежащее) + "перевернуло" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "Когда мы спускались вниз по реке" (придаточная часть).
- Средства связи: "Когда".
Не в моём характере, сэр, простираться перед кем-нибудь и доказывать свою правоту, когда мои слова берут под сомнение.
- Грамматическая основа: "простираться" (инфинитив) + "доказывать" (инфинитив).
- Сложноподчиненное предложение: "когда мои слова берут под сомнение" (придаточная часть).
- Средства связи: "когда".
Когда этот гул в первые донесся до нас, челны шли на расстоянии не скольких ярдов один от другого.
- Грамматическая основа: "челны" (подлежащее) + "шли" (сказуемое).
- Сложноподчиненное предложение: "Когда этот гул в первые донесся до нас" (придаточная часть).
- Средства связи: "Когда".
Запятые поставлены в соответствии с правилами пунктуации.