Главный итог политических репрессий Бориса Годунова заключался в укреплении его власти, но также и в углублении социальной напряжённости в стране. Годунов применял жесткие меры для устранения реальных и мнимых противников, что способствовало созданию атмосферы страха. Однако репрессии также усилили недовольство среди различных слоев общества, что в итоге оказало влияние на политическую ситуацию в России и способствовало кризису власти, уже после его правления.
Кроме того, репрессии способствовали увеличению числа недовольных и оппозиционно настроенных групп, что в конечном итоге привело к смутным временам и борьбе за власть после смерти Годунова. Таким образом, его подход к власти, основанный на репрессиях и устранении соперников, оказал долгосрочное влияние на политическую стабильность России в последующие годы.