В данном предложении запятая после слова "он" не требуется. Запятая в этом случае не ставится, потому что "как будто хотел сказать" является обстоятельственным оборотом, который не требует выделения запятой, если он не отделяется от главной части предложения. Предложение корректно записано без запятой:
"Он как будто хотел сказать: 'Доброе утро, пора вставать'."
Запятая ставится перед прямой речью после вводного выражения "как будто хотел сказать".