Она была дика и молчалива (1) и (2) если только я входил в любимую отцовскую комнату (3) где когда-то жила моя мать (4) и (5) где даже днём зажигались свечи (6) то она тот- час…

В предложении, которое вы привели, следует расставить запятые следующим образом:

Она была дика и молчалива (1), и (2) если только я входил в любимую отцовскую комнату (3), где когда-то жила моя мать (4), и (5) где даже днём зажигались свечи (6), то она тот час пряталась за большое (7) вольтеровское кресло отца (8) или за шкаф с книгами (9), или за дверь.

Таким образом, запятые ставятся:

1. После "молчалива" перед "и"
2. После "комнату" перед "где"
3. После "мать" перед "и"
4. После "свечи" перед "то"
5. После "книгами" перед "или"

Обратите внимание на то, что запятая перед "где" не ставится в случае, когда это относительное местоимение и продолжает мысль о предметах, находящихся в отцовской комнате.