Для того чтобы выбрать правильный вариант ответа на вопрос о том, где в годы войны велись работы по советскому атомному проекту, необходимо рассмотреть каждый из предложенных вариантов.
Спецлаборатория НКВД СССР - выполняла задачи, связанные с безопасностью и контрразведкой, но не специализировалась на научных исследованиях, связанных с атомной энергетикой.
Особый комитет при Наркомате обороны СССР - действительно существовал и занимался вопросами, связанными с оборонными исследованиями. Этот вариант может быть близок к правильному ответу, так как многие секретные проекты находились под его контролем.
Лаборатория № 2 Академии наук СССР - это именно то учреждение, где активно велись работы над атомным проектом. Исторические факты подтверждают, что именно здесь проходили важные исследования, связанные с ядерной физикой и атомной энергией.
Второй Специальный отдел НКВД СССР - подобно Спецлаборатории, этот отдел был в основном сосредоточен на контрразведке и охране секретных данных, а не на научно-исследовательской деятельности.
Наиболее точным и правильным вариантом является Лаборатория № 2 Академии наук СССР, так как именно здесь сосредоточивались усилия учёных для разработки атомного оружия в СССР в годы войны.
Ответ:
Лаборатория № 2 Академии наук СССР.