Давайте перепишем предложенные предложения, заменив числительные словами и выделив окончания числительных.
Маша перевернула тридцать первую страницу романа А. Фадеева «Молодая гвардия».
Окончание: -ю (перевернула тридцать первую)
А. С. Пушкин родился в тысяча семьсот девяносто девятом году.
Окончание: -ом (в тысяча семьсот девяносто девятом)
Сто двадцать пять километров мы преодолели с трудом.
Окончание: -ом (в сотый двадцать пятом)
Таким образом, все числительные переписаны словами, и окончания подчеркнуты.