Для решения данной задачи нужно проанализировать предложение и определить, где находятся запятые, которые разделяют части сложносочиненного предложения.
В данном случае предложение выглядит так:
"А когда возвращался Пустовалов, она рассказывала ему вполголоса про ветеринара и его несчастную семейную жизнь, и оба вздыхали и покачивали головами, говоря о мальчике, который, вероятно, скучает без отца."
Теперь давайте рассмотрим каждую запятую по порядку:
Запятая (1) — "А когда возвращался Пустовалов,..."
Здесь запятая не отделяет части сложносочиненного предложения. Она ставится перед придаточной частью "когда возвращался Пустовалов".
Запятая (2) — "...и она рассказывала ему вполголоса про ветеринара и его несчастную семейную жизнь, и оба вздыхали и покачивали головами,..."
Запятая (2) также не отделяет части сложносочиненного предложения. Она здесь является частью сложного предложения, отделяющим две части, связанные союзом "и".
Запятая (3) — "...и оба вздыхали и покачивали головами, говоря о мальчике,... "
Эта запятая отделяет обособленный оборот "говоря о мальчике" от главной части предложения.
Запятая (4) — "...о мальчике, который,... "
Запятая отделяет главную часть от придаточной, которая непосредственно относится к слову "мальчик". Это не требует особого внимания в контексте сочинительной связи.
Запятая (5) и Запятая (6) — "...который, вероятно, скучает без отца."
Здесь запятая (5) отделяет придаточную часть от главной, а запятая (6) выделяет вводное слово "вероятно", что не относится к сочинительной связи.
Итак, запятые между частями сложного предложения с сочинительной связью нет. Однако, запятая (2) стоит перед соединительным союзом "и", что указывает на связь между составными частями.
Таким образом, запятая между частями сложного предложения, связанными сочинительной связью, — это только цифра 2.
Ответ: 2.