Давайте разберем ваши словосочетания и найдем ошибку в согласовании имени существительного с именем числительным.
Больше пятисот учеников
Здесь числительное "пятисот" согласуется с существительным "учеников" в роде, числе и падеже. Всё правильно.К две тысячи двадцать пятому году
Здесь также всё в порядке: числительное "две тысячи двадцать пятый" согласуется с существительным "году". Правильно.В полутора километрах
Здесь числительное "полутора" (падежная форма от "один") согласуется с существительным "километрах". Согласование правильное.В сто двадцати пяти пунктах
Здесь также всё корректно. Числительное "сто двадцать пять" согласуется с существительным "пунктах".Пятеро медвежат
Здесь есть ошибка. Правильная форма — "пятеро медвежат" (числительное "пятеро" в именительном падеже), но в зависимости от контекста можно дополнительно указать, что если бы мы употребляли количественное числительное, то оно согласовывалось бы в другом падеже.
Таким образом, в последнем словосочетании "пятеро медвежат" нет ошибки в согласовании, так как "пятеро" корректно используется с "медвежатами". Однако, если вы имели в виду необходимость изменения формы какого-либо другого числительного, дайте знать!
Таким образом, в приведенных вами словосочетаниях ошибок нет. Все они правильные с точки зрения согласования.