Разберем текст с точки зрения пунктуации и объясним, почему в некоторых местах стоят запятые.
Тобольск в течение многих лет был деревянным.
- Запятая здесь не требуется, так как это простое предложение.
Он нередко горел и снова строился, возрождаясь заново.
- Запятая стоит перед "возрождаясь заново", потому что здесь используется обособленный оборот. "Возрождаясь заново" — это деепризивный оборот, который уточняет, как именно происходило действие (строился).
Видимо, пожары заставили наместников просить царя о строительстве каменным.
- Запятая стоит после "видимо", потому что это вводное слово. Оно не несет смысловой нагрузки в предложении, а добавляет отношение говорящего к сказанному.
Быстро выросли на мысу кремлёвские стены церквей и колонны зданий гражданских служб.
- Здесь запятая не нужна, так как это однородные члены предложения. "Кремлёвские стены" и "колонны зданий" являются однородными подлежащими.
В сплошь деревянной Сибири это были первые каменные постройки.
- Запятая не требуется, так как предложение простое и не содержит вводных или обособленных оборотов.
Подводя итог, запятые ставятся для обособления вводных слов, уточняющих оборотов и деепричастий. Понимание этих правил поможет вам правильно ставить запятые в сложных предложениях.