Для расстановки знаков препинания в предложении, следует внимательно проанализировать каждое место, где могут стоять запятые. Давайте разберем пункты по порядку.
Первое место (1): "Авдюхин пруд, возле которого Наталья назначила свидание Рудину". Здесь запятая необходима, так как это обособленный оборот.
Второе место (2): "Авдюхин пруд, возле которого Наталья назначила свидание Рудину, давно перестал быть прудом". Запятая перед "давно" не ставится, так как это не вводное слово, а обстоятельство времени.
Третье место (3): "Лет тридцать тому назад, его прорвало". Запятая должна стоять после "назад", поскольку это вводное выражение.
Четвертое место (4): "Лет тридцать тому назад, его прорвало, и с тех пор его забросили". Запятая не ставится, так как речь идет о сложносочинённом предложении с союзом "и".
Пятое место (5): "Только по ровному, и плоскому дну оврага". Здесь нужна запятая, так как "и" соединяет однородные члены предложения.
Шестое место (6): "Только по ровному и плоскому дну оврага, некогда затянутому жирным илом". Запятая необходима перед "некогда", поскольку это вводное слово.
Седьмое место (7): "Только по ровному и плоскому дну оврага, некогда затянутому жирным илом, да по остаткам плотины". Здесь также нужна запятая перед "да", так как это вводное слово.
Восьмое место (8): "да по остаткам плотины, можно было догадаться". Запятая здесь не нужна, так как это не сложноподчинённое предложение.
Девятое место (9): "можно было догадаться, что здесь был пруд". Запятая перед "что" необходима, так как это сложноподчинённое предложение.
Итак, запятые должны стоять в следующих местах:
- после "пруд" (1)
- после "назад" (3)
- после "дну" (5)
- перед "некогда" (6)
- перед "да" (7)
- перед "что" (9)
Таким образом, предложения с расставленными знаками выглядят следующим образом:
"Авдюхин пруд, возле которого Наталья назначила свидание Рудину, давно перестал быть прудом. Лет тридцать тому назад, его прорвало, и с тех пор его забросили. Только по ровному и плоскому дну оврага, некогда затянутому жирным илом, да по остаткам плотины можно было догадаться, что здесь был пруд."
Таким образом, запятые должны стоять в пунктах: 1, 3, 5, 6, 7, 9.