Давайте разберем каждое из предложений с точки зрения пунктуации и определим, в каком из них необходимо поставить запятую, а также обоснуем выбор.
В класс зашёл опоздавший на 5 минут Валера.
Здесь у нас есть обособленное приложение "опоздавший на 5 минут", которое уточняет, кто именно зашёл в класс. Поэтому это предложение требует запятой:
Правильный вариант: "В класс зашёл, опоздавший на 5 минут, Валера."Снег выпавший очень рано украсил крыши домов.
В этом предложении также присутствует обособленный обстоятельственный оборот "выпавший очень рано", который уточняет, какой именно снег украсил крыши. В этом случае, запятая необходима:
Правильный вариант: "Снег, выпавший очень рано, украсил крыши домов."Машина ехала вверх по улице обгоняя остальной транспорт.
Данное предложение не требует запятой, если рассматривать оборот "обгоняя остальной транспорт" как обстоятельство. Однако в зависимости от смысловой нагрузки можно выделить этот оборот запятой:
Правильный вариант: "Машина ехала вверх по улице, обгоняя остальной транспорт."На обед я съел большую тарелку супа и пюре.
Это предложение не требует запятой, так как тут представлено простое перечисление однородных членов, которое соединено союзом "и", и нет необходимости выделять его запятыми:
Правильный вариант: "На обед я съел большую тарелку супа и пюре."
Итак, в предложениях 1 и 2 необходимо поставить запятую, обосновывая это обособлением уточняющих оборотов. В предложении 3 запятая также допустима, если выделяем обстоятельственный оборот, а в предложении 4 знаки препинания не требуются.