Для решения данной задачи по поиску обособленных дополнений со значением включения, давайте анализировать каждое предложение.
"На всех берегах залива на протяжении сотен вёрст мною не было встречено ни одного человека и кроме горчайшей полыни и сухого бурьяна я не сорвал ни одной травинки."
В данном предложении обособленное дополнение со значением включения - "кроме горчайшей полыни и сухого бурьяна". Номер предложения: 1."Отряд за исключением трёх-четырёх человек «бездомных» по обыкновению распался на группки."
Здесь обособленное дополнение со значением включения - "за исключением трёх-четырех человек «бездомных»". Номер предложения: 2."У Бунина кроме блестящих совершенно классических рассказов есть необычайные по чистоте рисунки."
В данном случае, обособленное дополнение со значением включения - "кроме блестящих совершенно классических рассказов". Номер предложения: 3."Мы вместо подготовки к контрольной работе весь день бродили по городу."
Данное предложение не содержит обособленных дополнений со значением включения."Многие из бойцов помимо своей винтовки были вооружены трофейными автоматами."
Здесь обособленное дополнение со значением включения - "помимо своей винтовки". Номер предложения: 5.
Итак, обособленные дополнения со значением включения были обнаружены в предложениях 1, 2 и 3.