5. Расставь знаки препинания. Укажи все цифры, на месте которых должны стоять запятые. Авдюхин пруд (1) возле которого Наталья назначила свидание Рудину (2) давно перестал быть…

Давайте разберём предложение по частям и поставим запятые в нужных местах:

Текст с комментариями по необходимости запятых:

Авдюхин пруд (1) возле которого Наталья назначила свидание Рудину (2) давно перестал быть прудом.

• Здесь нужен запятый после «Авдюхин пруд», так как далее идёт уточнение «(1) возле которого…». Но поскольку «возле которого» — придаточное определительное, оно выделяется запятыми. Поэтому:
  Авдюхин пруд, (1) возле которого Наталья назначила свидание Рудину, давно перестал быть прудом.

Лет тридцать тому назад (3) его прорвало (4) и с тех пор его забросили.

• В этом случае между «Лет тридцать тому назад» и «его прорвало» нужна запятая, потому что это вводное выражение, уточняющее время:
  Лет тридцать тому назад, (3) его прорвало, (4) и с тех пор его забросили.

Только по ровному (5) и (6) плоскому дну оврага (7) некогда затянутому жирным илом (8) да по остаткам плотины можно было догадаться (9) что здесь был пруд.

• В этом сложном случае нужно разобраться по частям:

  • «Только по ровному (5) и (6) плоскому дну оврага (7)...»
    Здесь «по ровному и плоскому дну» — однородные определения, соединённые союзом «и». Перед «и» — запятая не нужна, так как они однородные, и запятые перед «и» ставятся, только если есть обособление. В данном случае — это однородные определения без обособления, значит запятая перед «и» не требуется.
    Но в условии — «по ровному (5) и (6) плоскому дну» — «по» (предлог) + два прилагательных «ровному» и «плоскому» — эти слова не требуют запятых.
    Однако, возможно, имеется в виду, что между «ровному» и «плоскому» стоит запятая, если они выделяются как однородные определения. В русском языке обычно запятая не ставится между однородными прилагательными, если они связаны Союзом «и»:
    по ровному и плоскому дну — запятая не нужна.
    Значит, тут запятая не ставится.

• «от оврага (7) некогда затянутому жирным илом (8)»
  — «от оврага» — это дополнение.
  — «некогда затянутому жирным илом» — причастный оборот, определяющий «оврага», причастие «затянутому» — здесь запятая нужна перед причастным оборотом, так как он даёт пояснение.
  Поэтому:
  «от оврага (7), некогда затянутому жирным илом (8), да по остаткам плотины можно было догадаться...»

• «да по остаткам плотины можно было догадаться (9) что здесь был пруд.»
  Перед «что» — частица «что» вводит придаточное, оно обычно выделяется запятой:
  «да по остаткам плотины можно было догадаться, (9) что здесь был пруд.»

Итоговая расстановка запятых:

Авдюхин пруд, (1) возле которого Наталья назначила свидание Рудину, давно перестал быть прудом.
Лет тридцать тому назад, (3) его прорвало, (4) и с тех пор его забросили.
Только по ровному и (6) плоскому дну оврага (7), некогда затянутому жирным илом (8), да по остаткам плотины можно было догадаться, (9) что здесь был пруд.

Ответ:

Цифры, на месте которых ставятся запятые: 1, 3, 4, 6, 7, 8, 9.