В данном предложении имеется два описания, соединённых союзом "а":
"С северо-востока от собора находится церковь, построенная в конце 14 века, а с юго-востока — восьмигранная шатровая колокольня."
Обнаруживается следующая структура:
Первая часть:
"С северо-востока от собора находится церковь, построенная в конце 14 века," — полный самостоятельный компонент с подлежащим "церковь" и сказуемым "находится".Вторая часть:
"а с юго-востока — восьмигранная шатровая колокольня." — здесь есть подлежащее "восьмигранная шатровая колокольня" и подразумеваемое сказуемое "находится" или "расположена", хотя оно явно не выражено.
Ответ:
Да, во втором предложении есть неполное предложение. Оно опущено, так как отсутствует сказуемое (глагол-сказуемое, поясняющее расположение или состояние объекта), хотя контекст его подразумевает.
Итак: В предложении есть неполное предложение, так как во второй части отсутствует явное сказуемое.