Привет! Отличная попытка, ты подумал и выбрал "их". Но в данном случае нам нужно подобрать ограничительно-выделительнуючастицу, которая показывает, что предположение было только так, а не иначе.
Правильные слова — "лишь", "только", "исключительно", "просто". Они подчеркивают, что раньше считалось, что шипики именно дырявят бактерии, но на самом деле ситуация другая.
Твое "их" здесь не подходит, потому что оно — местоимение, которое не выражает ограничение или исключение. Нам нужно именно слово, которое вводит ограничение или подчеркивает исключительность.
Постараюсь объяснить проще: если бы в предложении стоял "лишь", то смысл был бы — только так думали, больше никаких вариантов.
Так что правильный ответ — одно из слов: "лишь", "только", "исключительно", "просто". Они вводят ограничение.
Пожалуйста, попробуй еще раз или скажи, если что-то непонятно. И не забудь оценить мой ответ лайком или дизлайком!