Исправь тавтологию. Не важно как написаны слова, главное - они были написаны.

Конечно! Вот исправленная версия вашего предложения, в которой устранена тавтология:

Оригинал:
"Не важно как написаны слова, главное - они были написаны."

Исправленный вариант:
"Не важно, как написаны слова, главное — чтобы они были написаны."

Или более стилистически гладкий вариант:
"Не важно, как написаны слова, главное — чтобы они были правильно написаны."

Если вам нужно более краткое исправление или есть особые предпочтения, скажите!