Давайте пошагово разберем задачу.
Исходные данные:
Последовательность ДНК:
ГАГ - ЦГА - ЦТТ - ТТГ - АГГ - ЦЦЦ - ГЦТ - ГАГ
Обозначим ее как:
- ГАГ
- ЦГА
- ЦТТ
- ТТГ
- АГГ
- ЦЦЦ
- ГЦТ
- ГАГ
Интронные части: 2, 3, 6 и 7 триплеты.
То есть, триплеты 2, 3, 6 и 7 — интроны, остальные — экзоны.
Шаг 1: Записать последовательность без интронов (сплайсинг)
Итак, исключая интроны (пункты 2, 3, 6, 7), получаем:
- ГАГ
- ТТГ
- АГГ
- ГАГ
Объединяем их:
ГАГ - ТТГ - АГГ - ГАГ
Шаг 2: Найти комплементарную цепь ДНК
Правила комплементарных пар:
- Г (гуанин) ↔ Ц (цитозин)
- А (аденин) ↔ Т (тимин)
Для чтения цепи:
«Исходная» (направление 5’→3’) — верхняя, комплементарная — снизу (или наоборот).
Но в условии не указано направление, предположим, что всё идет 5’→3’ сверху вниз.
Для комплементации:
Перейдем к последовательности без интронов:
ГАГ ТТГ АГГ ГАГ
Находим комплементарную:
- ГАГ → ЦЦТ
- ТТГ → ААЦ
- АГГ → ТЦЦ
- ГАГ → ЦЦТ
Запишем: ЦЦТ — ААЦ — ТЦЦ — ЦЦТ
Шаг 3: Записать РНК-транскрипт
РНК синтезируется по матрице — цепи DNA, замещая Т (тимин) на У (уран).
Используя исходную цепь (подойдет или комплементарная цепь ДНК), выберем матрицу — DNA-цепь, служащую шаблоном для РНК.
Стандартно, если исходная цепь — coding strand, то я использую ее для транскрипции.
Но в задачах чаще транскрипция идет по матрице, которая является комплементарной (одинаковая по направлению, за исключением Т→У).
Для простоты возьмем цепь, полученную из данной.
Если исходная (кодирующая) цепь — это последовательность "ГАГ ЦГА ЦТТ ТТГ АГГ ЦЦЦ ГЦТ ГАГ"
Тогда, транскрипт по этой цепи (заменяя Т на У):
Гаг → Гаг (равнозначно, пишем строчно)
Цга → Цга
Цтт → Цуу
Ттг → Уу г
агг → аг г
ццц → цц ц
гцт → гц у
гаг → гаг
Но правильнее понять, что при транскрипции, РНК совпадает по порядку с кодирующей цепью, за исключением:
Итак:
ГАГ → ГАГ (в РНК: G A G)
ЦГА → ЦГА (C G А)
ЦТТ → ЦУУ (C U U)
ТТГ → УУ г (U U G)
АГГ → АГГ (A G G)
ЦЦЦ → ЦЦЦ (C C C)
ГЦТ → ГЦ У (G C U)
ГАГ → ГАГ (G A G)
Итак, последовательность РНК:
ГАГ - ЦГА - ЦУУ - УУГ - АГГ - ЦЦЦ - ГЦУ - ГАГ
Шаг 4: Последовательность РНК после сплайсинга
После сплайсинга, как мы уже знаем, у нас экзоны: 1, 4, 5, 8 — вот их последовательность РНК:
- ГАГ → ГАГ
- УУГ → УУГ
- АГГ → АГГ
- ГАГ → ГАГ
Объединяем:
ГАГ - УУГ - АГГ - ГАГ
Итоговые ответы:
1. Последовательность комплементарной цепи ДНК (отфильтрованная):
ЦЦТ — ААЦ — ТЦЦ — ЦЦТ
2. Последовательность РНК-транскрипта:
ГАГ - ЦГА - ЦУУ - УУГ - АГГ - ЦЦЦ - ГЦУ - ГАГ
3. Последовательность РНК после сплайсинга:
ГАГ - УУГ - АГГ - ГАГ
Если нужно, я могу дать более подробное объяснение каждого шага.