Что значит “…иметь хоть в зачатке „Во Имя””: здесь речь об идее или призыве, начинающемся словами «во имя…»; фраза с троеточием указывает на то, что перед этим были иные слова, а теперь есть лишь зачаток такого обращения. Это значит — есть хотя бы небольшой мотив действовать под эгидой какого‑то священного или авторитетного призыва (например, Бога, Отчества или идеи).
Почему „Имя” написано с заглавной буквы: автор stylistically выделяет слово как особое, сакральное или персонифицированное понятие. «Имя» как часть формулы «Во Имя» у Блока может означать не просто словосочетание, а конкретное Богом or священным призывом название/сущность, которую следует почитать и на которую ссылаются. Это усиление значимости и уравнивание слова с именем Бога или иного сильного начала.
Если хочешь, могу привести конкретные примеры из текста и пояснить в контексте стихотворения.