Zn(SO4)2 индекс 2 относится к цинку или нет?

Нет. Индекс 2 относится к группе (SO4): Zn(SO4)2 означает, что к одному цинку привязано две сульфатные группы.

Однако для нейтрального соединения цинковый сульфат имеет формулу ZnSO4 (одна сульфатная группа на один Zn). Формула Zn(SO4)2 не сбалансирована по заряду и не является обычной формулой цинкового сульфата (хотя встречаются гидраты, например ZnSO4·7H2O).