Существует метод оценки количества копий молекул ДНК с определённой последовательностью — ПЦР в реальном времени (англ. real-time PCR). В основе метода лежит полимеразная цепная…
Существует метод оценки количества копий молекул ДНК с определённой последовательностью — ПЦР в реальном времени (англ. real-time PCR). В основе метода лежит полимеразная цепная реакция (ПЦР), результат которой оценивается по интенсивности флуоресценции связавшихся с ДНК светящихся меток. Чем больше было исходное количество молекул ДНК с интересующей последовательностью, тем выше будет уровень флуоресценции. Метод нашёл широкое применение в различных областях, однако он имеет свои ограничения. Для какой задачи ПЦР в реальном времени неприменим?
Real-time PCR может количественно определить копии конкретной известной последовательности ДНК, используя специфичные праймеры и, по желанию, зонд. Поэтому она не применима к задачам, где требуется обнаружение или секвенирование неизвестной последовательности (де нovo секвенирование, составление карты генома, поиск новых участков без заранее заданной мишени). Также она не дает информации о самой последовательности — лишь количество целевой фрагмента.
