Да, запятая нужна. Правильная пунктуация: Перелётные птицы пролетают косяком над покосившимися крышами, и их крик печально затухает в синеющем небе.
Пояснение по шагам:
- Разделяем предложение на части. Здесь два простых предложения, соединённых сочинительным союзом "и":
- Перелётные птицы пролетают косяком над покосившимися крышами.
- их крик печально затухает в синеющем небе.
- Части не имеют общего подлежащего: в первой части подлежащее — "птицы", во второй — "крик" (с определением "их"). Значит это сложносочинённое предложение, и между частями ставится запятая перед союзом "и".
- Приведённые орфографические пометки можно исправить на современные формы: "Перелётные", "покосившимися", "синеющем" и т. д.
Дополнительный вариант с паузой (не обязательно, но допустимо): можно поставить тире вместо запятой для подчеркнутого пауза и контраста: Перелётные птицы пролетают косяком над покосившимися крышами — и их крик печально затухает в синеющем небе.
Но стандартная форма — с запятой перед "и".