Выберите все подходящие ответы из списка Верно решил 381 учащийся Из всех попыток 13% верных В гене GCK можно обнаружить сигналы недавнего положительного отбора при помощи iHS В генах HLA-региона можно найти несколько сигналов положительного отбора Количество интрогрессированных аллелей, находящихся под действием положительного отбора в европейской популяции, равно 434 В гене LCT можно найти сигналы отбора с использованием как LD-методов, так и других подходов В гене MAPT нет сигналов недавнего положительного отбора В гене ALDH9A1 можно обнаружить значительное популяционное разделение между популяциями CEU и CHB

К сожалению, в формулировке задачи не приведены конкретные данные или источник, на котором основаны эти утверждения. Ниже дам логический разбор и обоснование для каждого пункта. Я выделю те положения, которые в общем виде соответствуют распространённым_Data о сигналах отбора и методах их обнаружения, и поясню, почему некоторые утверждения сомнительны или требуют конкретного набора данных. Короткий итог (что можно считать наиболее надёжно верным без дополнительной информации) - В гене LCT действительно можно обнаружить сигналы отбора с использованием как LD-методов, так и других подходов. Это классический пример недавно произошедшего позитивного отбора на лактазную резистентность у европейцев. - В генах HLA-региона часто наблюдают сильное избыточное разнообразие и сигналы отбора; хотя в этой области доминирует балансирующий отбор, встречаются и сигналы положительного отбора в отдельных локусах. Поэтому формулировка «несколько сигналов положительного отбора» в HLA-регионе в общем случае допустима. Какие пункты можно считать верными, какие — сомнительными (и почему) 1) Верно решил 381 учащийся - Это не биологическое утверждение, это мета-информация о тесте. В контексте задачи по генетике она не относится к самим сигналам отбора. Не включаем в перечень биологических ответов. 2) Из всех попыток 13% верных - Аналогично выше: статистика теста, не касается содержания генетических сигналов. Тоже не относится к биологическим фактам о генах. 3) В гене GCK можно обнаружить сигналы недавнего положительного отбора при помощи iHS - Возможность использования iHS для любого генома или локуса существует, но конкретное утверждение зависит от эмпирических данных по GCK. Без ссылки на конкретное исследование это утверждение нельзя подтвердить как истинное. Учитывая отсутствие широко известной общепризнанной легенды именно для GCK, качество данного утверждения можно считать сомнительным или требующим проверки по данным. 4) В генах HLA-региона можно найти несколько сигналов положительного отбора - Возможна: регион HLA характеризуется очень высоким разнообразием и историей отбора в разных локациях. Часто встречаются сигналы отбора, включая как балансирующий, так и локальные сигналы положительного отбора на отдельных аллелях/локусах. Это утверждение plausibile и может считаться верным в общем контексте генетики популяций. 5) Количество интрогрессированных аллелей, находящихся под действием положительного отбора в европейской популяции, равно 434 - Это очень конкретное число. Без ссылки на конкретное исследование такое утверждение недоказуемо и, скорее всего, неверно. Вероятность того, что именно 434 аллеля соответствуют условиям «introgressed и под положительным отбором» в Европе, маловероятна без источника. Скорее всего, это либо неверное число, либо требует проверки по конкретному набору данных. 6) В гене LCT можно найти сигналы отбора с использованием как LD-методов, так и других подходов - Это точно верно. Лактазная персистентность (LCT) — классический пример недавнего положительного отбора у европейцев. Её сигналы обнаруживались с помощью LD-методов (например, iHS, XP-EHH, долгие выпуклости однородности уходящих haplotypes) и других подходов (частоты аллелей, FST и пр.). Это утверждение является надёжно верным. 7) В гене MAPT нет сигналов недавнего положительного отбора - Это утверждение спорно. MAPT (генtau) известен своей сложной haplotype-структурой и исследованиями, которые указывают на исторические сигналы отбора в этом регионе. Заявление «нет сигналов» противоречит части литературы, где обсуждают подписанные сигнатуры селекции в регионе MAPT. Скорее всего это утверждение неверно. 8) В гене ALDH9A1 можно обнаружить значительное популяционное разделение между популяциями CEU и CHB - Без конкретной выборки данных это утверждение трудно подтвердить. ALDH9A1 не является одним из наиболее известных примеров сильно дифференцированных генов между европейскими и восточноазиатскими популяциями (в отличие, например, от ALDH2 в East Asians). Поэтому это утверждение требует проверки по данным и не является общеизвестным фактом. С высокой долей вероятности можно считать его сомнительным без специфических данных. Каковы рекомендации по ответу на практике - Строгое правдивое выделение без ссылок на источник: - Верные: - В гене LCT можно найти сигналы отбора с использованием как LD-методов, так и других подходов. - В генах HLA-региона можно найти несколько сигналов положительного отбора (хотя там преобладает балансирующий отбор, существуют и локальные сигналы положительного отбора). - Неверно/сомнительно: - MAPT: утверждение о полном отсутствии сигналов положительного отбора скорее неверно. - GCK: утверждение зависит от конкретного набора данных; без источника проверить нельзя. - 434 интрогрессированных аллелей: требует конкретного источника. - ALDH9A1: требует данных; без них утверждать трудно. Если хотите, могу: - Помочь проверить конкретные публикации или наборы данных, на основе которых могли быть сформулированы эти утверждения. - Показать, как самому проверить каждое утверждение на практике (какие тесты использовать: iHS, XP-EHH, FST, методы для обнаружения introgression, LD-методы и пр.), и какие критерии считать доказательством сигнала отбора в каждом случае.