Краткий ответ: 3.
Все персонажи, которых изображает автор, имеют реальных прототипов.
Заменяем придаточную часть причастным оборотом:
\[ \text{которых изображает автор} \longrightarrow \text{изображаемые автором} \]
Получается:
Все персонажи, изображаемые автором, имеют реальных прототипов.
Почему это возможно
В придаточной части:
- автор — действующее лицо;
- которых — объект действия: автор изображает персонажей;
- от глагола изображать образуется страдательное причастие настоящего времени изображаемые;
- причастие согласуется со словом персонажи.
В других вариантах требуется изменить сам глагол или всю конструкцию: например, «которых мы добились» нельзя заменить причастием от глагола добиться без подбора другого глагола.