Кратко: тема здесь — согласие и подтверждение. Подойдут слова и выражения, которыми можно ответить «да»: согласиться, подтвердить, одобрить или вежливо разрешить.
Нейтральные и книжные: да, конечно, разумеется, безусловно, несомненно, бесспорно, неоспоримо, очевидно, естественно, действительно, верно, точно, так, именно так, согласен, согласна, подтверждаю, одобряю, поддерживаю, разрешаю, непременно, обязательно.
Вежливые: с удовольствием, охотно, я не против, буду рад, можете рассчитывать, считайте, что да, пожалуйста, договорились, принимается, хорошо, ладно.
Разговорные: ага, угу, ну да, да-да, конечно же, ещё бы, ясное дело, известное дело, само собой, само собой разумеется, что за вопрос, не вопрос, без проблем, идёт, лады, окей, так и есть, вот именно.
Устойчивые выражения: вне всякого сомнения, без сомнения, и говорить нечего, что и говорить, как же иначе, не иначе, разумеется да.
Как проверить: вставь слово в диалог:
— Ты придёшь?
— Конечно.
Если ответ выражает согласие, слово подходит. В записи «да, конечно» нужна запятая.