Кратко: слова в скобках ставятся в нужный падеж и число по смыслу. Вот исправленный текст:
В лесу пять этажей. Верхний этаж — это верхушки самых высоких сосен, елей, дубов. Здесь обитают иволги, ястребы. Четвёртый этаж — кроны рябин, клёнов, берёз, осин. На этом этаже живут белки, сойки, сороки. Третий этаж — кусты шиповника, орешника и молодые деревца. На них гнездятся мелкие птицы. Второй этаж — мхи и лишайники. Здесь зимуют мыши. Первый этаж — лесная подстилка. В ней живут жуки и черви. Есть в лесу и хищники: лисы, совы. (По Н. Сладкову.)
Как понять падежи:
- После «пять», «верхушки», «кроны», «кусты чего?» нужен родительный падеж:
пять этажей, сосен, елей, дубов, рябин, клёнов, берёз, осин, шиповника, орешника. - Если слова называют тех, кто живёт или гнездится, — именительный падеж:
белки, сойки, сороки, птицы, мыши, жуки, черви, лисы, совы. - У слов сосен, рябин, берёз, осин окончание нулевое.
Проверка: «пять (чего?) этажей», «верхушки (чего?) сосен», «живут (кто?) белки» — падеж выбран верно.