Буквы е ю и я когда-нибудь означает два звука

Да, это верно. Буквы "е", "ю" и "я" могут иметь различные звуковые значения в разных словах и контекстах. Например, "е" может звучать как [э] в слове "этот" и как [е] в слове "елка". Аналогично, "ю" может произноситься как [у] в слове "гудок" и как [ю] в слове "юмор", а "я" может быть [а] в слове "яблоко" и [йа] в слове "яма". Важно помнить, что произношение букв зависит от слова, в котором они находятся.