Для определения матричной цепи ДНК, необходимо сопоставить последовательность нуклеотидов с таблицей генетического кода и учитывать, что первая аминокислота в белке АСП является метионином (Met).
Сначала проведем транскрипцию данной последовательности нуклеотидов. Для этого заменим тимин (Т) на урацил (Τ), так как в результате транскрипции в молекуле РНК тимин заменяется урацилом.
Исходная последовательность ДНК: 5'-ТАЦЦЦТГТЦГАГАГЦ-3' 3'-АТΓΓΓАЦАГЦТЦТЦГ-5'
После замены тимина на урацил: 5'-UAСССУCАСUGАГАГЦ-3' 3'-ΑΤΓΓΓАЦАГЦТЦТЦГ-5'
Теперь проведем трансляцию полученной РНК последовательности, используя таблицу генетического кода.
Последовательность РНК: 5'-UACCCUCACUGAGAGC-3'
Сопоставляя последовательность с таблицей генетического кода, получаем следующую последовательность аминокислот в белке: Мет - Пролин - Глутамин - Глутамин - Серин.
Теперь определим, какая цепь является матричной (транскрибируемой). Поскольку транскрипция происходит по комплементарности - матричная цепь ДНК обладает той же последовательностью, что у полученной РНК, за исключением замены урацила на аденин, и соответствует 3'-5' цепи ДНК.
Таким образом, 3'-АТΓΓΓАЦАГЦТЦТЦГ-5' является матричной цепью ДНК.
Полученная последовательность РНК: 5'-UACCCUCACUGAGAGC-3'
Соответствующая последовательность белка: Мет - Пролин - Глутамин - Глутамин - Серин.
